环保工程资质的办理流程如下：

一、申请环保工程资质的流程

1. 准备材料：申请环保工程资质需要提交以下材料：公司营业执照、组织机构代码证、税务登记证、公司章程和申请表。

2. 网上提交申请：访问中国政府服务网平台或前往当地政务大厅，进入环保部门或建设部门，提交申请并选择相应的环保工程专业承包资质。

3. 接受现场核查：提交申请后，当地政府会安排现场核查，检查公司的办公场所、生产设备和人员配备等是否符合要求。

4. 获得资质证书：如果公司的条件符合要求，政府将颁发环保工程资质证书。

二、环保工程资质的办理注意事项

1. 申请材料必须真实有效：申请材料必须真实有效，不能造假，否则会被政府列入黑名单，影响公司信誉。

2. 人员要求：申请环保工程资质需要有一定数量的技术人员和工程师，具体数量要求可以参考当地政府官网公布的资质标准。

3. 注册资本要求：申请环保工程资质需要有一定的注册资本，具体金额要求可以参考当地政府官网公布的资质标准。

总之，办理环保工程资质需要按照政府规定的流程和要求进行申请和审核，确保公司的条件符合标准，并准备好相应的申请材料。