专利申请是为了保护我们的发明创造不受他人侵权，保护自己的合法权益。这本身是一件好事，但是有时候一不小心卷入到了专利的纠纷问题当中可是非常麻烦的一件事，这种时候我们也不能够太过着急，要想办法赶紧解决这种纠纷。

专利权纠纷是时有发生的事情，专利权的纠纷可以从很多方面体现出来，从开始的研发按到申请费用缴纳，到专利权授权的主体这些都会有不同程度的纠纷，专利权纠纷主要体现在专利权的归属于谁的问题；专利纠纷是有关专利的争执。可表现为在专利申请过程中发生的争执和在专利申请被批准后所发生的争执。

专利申请遇到纠纷应该怎么处理？

后一种争执主要表现为因专利权的行使、维护、转让、许可而引起的争执。对专利纠纷，当事人可要求专利管理机关处理，也可向法院提起诉讼。有些专利纠纷法律规定只能由专利管理机关处理，不得向法院起诉；专利申请权纠纷是专利纠纷中的一类，主要包括：一是关于职务发明创造还是非职务发明创造的纠纷；二是关于谁是发明创造的发明人或设计人的纠纷；三是关于协作(合作)完成或者接受委托完成的发明创造，谁有权申请专利的纠纷。

常见的专利权纠纷还有使用发明创造的费用纠纷、关于实施强制许可使用费的纠纷、专利许可或专利转让合同纠纷、专利权归属纠纷是指发明创造在被授予专利权之后，有关当事人之间就谁应当是真正的权利人所发生的确权纠纷；这些专利纠纷都需要体现专利权的主体，专利申请最后的是属于谁的，但是最终还是要看专利人

关于权利的纠纷问题主要建议专利人在申请的时候确定好相关的合同规定，不管是职务发明还是非职务发明纠纷，不管是合作关系还是委托关系，都需要有合同作为证据，有了证据对专利权纠纷的处理好多了，当今时代一切以法律为准绳，因此凡事都需要有证据。